هیات ویژه منتخب شورای نگهبان که جهت بررسی روند انتخابات و بازشماری صندوقهای رای تشکیل شده بود، در بیانیهای روند کاری صورتگرفته را تشری کرد.
در این بیانیه آمده است:
شورای محترم نگهبان با دو هدف ارتقای قانونمداری و حفظ حقوق شهروندان به ویژه نامزدهای محترم دهمین دوره انتخابات ریاستجمهوری اسلامی ایران و هواداران آنها و افزایش سطح اعتماد عمومی در تاریخ 3/4/1388 طی نامهای از مقام معظم رهبری درخواست کرد با تمدید مهلت قانونی رسیدگی به شکایات موافقت فرمایند، این درخواست مورد قبول و موافقت قرار گرفت.
متعاقب آن آیتالله جنتی نظر شورای نگهبان را در مورد تشکیل هیات ویژه با حضور حجتالاسلام دری نجفآبادی، ابوترابی، رحیمیان و آقایان افتخاری جهرمی، ولایتی، حدادعادل، محمدرضا تابش و محمدرضا خباز، به منظور بررسی دقیق روند انتخابات و بازشماری حداقل ده درصد صندوقهای رای و گزارش آن به شورای نگهبان، نامزدهای محترم و مردم شریف ایران اعلام نمودند و جناب حجتالاسلام آقای ابوترابی نیز ماموریت یافت نظر شورای نگهبان را به اطلاع اعضای پیشنهادی هیات ویژه برساند.
اعضای هیات ویژه با عنایت به اهمیت موضوع و شرایط خاص کشور و ضرورت افزایش سطح اعتماد عمومی از پیشنهاد شورای نگهبان استقبال نمودند و آقایان تابش(رییس فراکسیون اقلیت مجلس) و خباز، عضو محترم فراکسیون اقلیت مجلس شورای اسلامی(و عضو برجسته ستاد جناب حجتالاسلام و المسلمین آقای کروبی) نیز موافقت نمودند در صورت معرفی از سوی نامزدهای معترض به چگونگی برگزاری انتخابات، در هیات ویژه حضور داشته باشند. بر این اساس نامهای از سوی شورای محترم نگهبان برای نامزدهای ممعترض به چگونگی برگزاری انتخابات، جناب آقای میرحسین موسوی و جناب حجتالاسلام آقای کروبی ارسال گردید و ضمن معرفی 6 نفر اعضای هیات ویژه از آنان دعوت گردید، نمایندگان خود را برای شروع کار هیات ویژه با حضور آنان معرفی نمایند.
صبح روز جمعه 5/4/88 اعضای هیات ویژه رسیدگی در یک جلسه طولانی حدود پنج ساعت باتفاق آرا به این نتیجه رسیدند برای رسیدگی به شکایات و تحقیق در درستی یا نادرستی شبهه تقلب در انتخابات باید:
اولا: شکایات نامزدهای محترم به طور دقیق توسط نمایندگان آنان تبیین گردد.
ثانیا: راهکارهای راستی آزمایی انتخابات با حضور و موافقت آنان تعریف و مشخص شود.
ثالثا: با حضور ایشان و نمایندگان مورد اعتماد آنان روشهای راستی آزمایی مورد توافق اجرایی گردد و صندوقهای رای مورد بازشماری قرار گیرد.
در مرحله ای از مذاکرات نکات زیر به عنوان انتظارات یکی از کاندیداهای محترم از شورای نگهبان مطرح گردید:
1-الف: شورای نگهبان میزان دقیق تعرفههای چاپ شده را تعیین نماید و میزان تعرفه مازاد در اختیار هیات مورد اعتماد قرار گیرد.
ب: کلیه ته برگها که حاوی مشخصات رایدهندگان است در اختیار مجموعه مورد اعتمادی قرار گیرد تا با اطلاعات موجود در پایگاه اطلاعاتی جمعیتی کشور تطبیق داده شود.
ج: یک سوم صندوقهای سیار و معادل با کسری از آن مثلا 20 درصد از صندوقهای ثابت به صورت تصادفی(رندم) بازگشایی و محتوای آن مورد بررسی قرار گیرد.
د: صندوقهای بعضی از استان ها که آرای آنها بیش از واجدین شرایط است مثل یزد و مازندران بازشماری گردد.
2ـ کلیات مفاد بندهای الف، ب، ج، د مورد قبول شورای محترم نگهبان قرار گرفت البته شورای نگهبان تاکید داشتند در مورد بند ب با نظر کارشناسان ذیربط به صورت تصادفی(رندم) عمل گردد و در صورت مشاهده خلاف تا حصول اطمینان صحت یا بطلان ادامه پیدا کند.
بعضی از اعضای هیات ویژه تا بعد از ظهر روز دوشنبه هشتم تیرماه 88 با پیگیری جدی و دیدارها و مذاکرات متعدد با چهرههای شاخص و موثر دینی و سیاسی به ویژه دو کاندیدای محترم معترض بر چگونگی برگزاری انتخابات از آنان درخواست نمودند با معرفی نمایندگان خود به رسیدگی منطقی و بیطرفانه شبهات کمک نمایند و مجمع تشخیص مصلحت نظام نیز در بیانیه مورخ 6/4/88 خود ضمن استقبال از تمدید مهلت و تعیین هیات ویژه، نامزدهای محترم را به همکاری با هیات رسیدگی به شکایات و بازشماری آرا دعوت کرد.
متاسفانه هیچ یک از این مذاکرات و تلاشها نتیجه ای نبخشید و دو نامزد محترم و معترض در نامههایی به شورای محترم نگهبان پیشنهاداتی را مطرح نمودند که انجام آن توسط شورای نگهبان مقدور نبود و نهایتا نماینده خود را معرفی ننمودند. در نتیجه در این مرحله شورای نگهبان راسا تصمیم به بازشماری 10 درصد از صندوقهای رای در سراسر کشور گرفت.